Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApcsP12246 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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