Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms