Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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