Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01673 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01673 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01673 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01673 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms