Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms