Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bnc1O35914 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms