Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms