Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms