Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casq1O09165 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casq1O09165 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Casq1O09165 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms