Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3248K7N721 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3248K7N721 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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