Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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