Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930444G20RikD3Z741 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms