Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint8A7XV07 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms