Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms