Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RBM42Q9BTD8 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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