Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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VAT1Q99536 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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VAT1Q99536 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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VAT1Q99536 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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VAT1Q99536 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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VAT1Q99536 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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VAT1Q99536 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAT1Q99536 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAT1Q99536 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAT1Q99536 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAT1Q99536 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAT1Q99536 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAT1Q99536 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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