Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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