Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC47Q96A33 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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