Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SAMD1Q6SPF0 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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