Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNGA3Q16281 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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