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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
RNU6-1175P-201
ENST00000365200
107 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-811P-201
ENST00000384069
107 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU5A-6P-201
ENST00000384136
116 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR563-201
ENST00000385080
79 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU2-9P-201
ENST00000410194
145 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
FCF1P9-201
ENST00000412546
282 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
LINC01312-201
ENST00000412745
775 nt
TSL 3
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RPL21P38-201
ENST00000418090
167 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC244250.2-201
ENST00000418731
148 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC092783.1-201
ENST00000435832
231 nt
TSL 3
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
DIP2A-IT1-201
ENST00000442434
428 nt
TSL 2
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MTATP6P26-201
ENST00000445926
662 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RPL30P10-201
ENST00000488148
337 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU4ATAC8P-201
ENST00000516196
109 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
CR383656.4-201
ENST00000546909
122 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR548AB-201
ENST00000584917
84 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR6514-201
ENST00000622549
70 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR30D-201
ENST00000362283
70 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-1120P-201
ENST00000362988
108 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-454P-201
ENST00000364292
107 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.361-201
ENST00000365515
120 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
U8.17-201
ENST00000391292
132 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.621-201
ENST00000411065
96 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MCFD2P1-201
ENST00000417812
300 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MTCO1P20-201
ENST00000425366
358 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RPS29P8-201
ENST00000445109
171 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SCARNA11.2-201
ENST00000517183
154 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU7-181P-201
ENST00000517234
74 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC084365.1-201
ENST00000552470
310 nt
TSL 3
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
LINC02277-202
ENST00000556472
453 nt
TSL 3
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR4677-201
ENST00000584153
80 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORD115-24-201
ENST00000363528
82 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
SNORD114-28-201
ENST00000363610
72 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-1048P-201
ENST00000364054
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-214P-201
ENST00000384130
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR1257-201
ENST00000408490
117 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-1165P-201
ENST00000410119
107 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RPL30P16-201
ENST00000419341
429 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MTCYBP8-201
ENST00000422855
651 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AL031667.1-201
ENST00000440222
725 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC109327.2-201
ENST00000448339
378 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC073415.1-201
ENST00000449240
153 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AL033528.1-201
ENST00000453780
140 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
snoU13.16-201
ENST00000459350
104 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC096736.2-201
ENST00000507972
175 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC134698.4-201
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826 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
ELOCP32-201
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324 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC107023.1-201
ENST00000552757
356 nt
TSL 5
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR4432-201
ENST00000581823
84 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
POLR3GP1-201
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261 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AL357078.3-201
ENST00000607528
618 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AL391834.2-201
ENST00000609982
546 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
TUSC7.1-201
ENST00000610969
165 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR6507-201
ENST00000613630
70 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNA5SP205-201
ENST00000364653
136 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR625-201
ENST00000385047
85 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
OPRPN-201
ENST00000399575
1040 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC036101.1-201
ENST00000449272
597 nt
TSL 3
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MCHR2-AS1-203
ENST00000451220
429 nt
TSL 3
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
TPTE2P5-203
ENST00000458118
728 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC017015.2-201
ENST00000497946
376 nt
TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-469P-201
ENST00000516253
101 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU2-60P-201
ENST00000517290
128 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC022616.4-201
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181 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC011458.1-201
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617 nt
BASIC
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SNCB
Q16143
AC244669.1-204
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178 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC005609.4-201
ENST00000625071
447 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
NAA50-211
ENST00000630058
177 nt
TSL 5
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR6759-201
ENST00000638110
65 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
LRRIQ3-204
ENST00000395089
2673 nt
APPRIS P2
TSL 5
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR148A-201
ENST00000362215
68 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-281P-201
ENST00000384212
103 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
SNORD38C-201
ENST00000384381
69 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR7-2-201
ENST00000384970
110 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
SNORA40.4-201
ENST00000390971
128 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
GRM7-AS3-203
ENST00000424366
486 nt
TSL 3
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC108059.2-201
ENST00000434626
151 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AL160162.1-201
ENST00000456715
442 nt
TSL 3
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
U8.19-201
ENST00000459095
133 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
U8.22-201
ENST00000459141
133 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC114755.3-201
ENST00000481111
251 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR4436A-201
ENST00000585278
85 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AL158050.2-201
ENST00000605336
568 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
Pinc.1-201
ENST00000616452
154 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC023510.2-201
ENST00000622162
746 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
Y_RNA.172-201
ENST00000363765
102 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
Y_RNA.185-201
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100 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
Y_RNA.270-201
ENST00000364693
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BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
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BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
SNORA24-201
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131 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-480P-201
ENST00000384332
107 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR588-201
ENST00000384900
83 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR513B-201
ENST00000385136
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BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
SNORA40.3-201
ENST00000390964
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BASIC
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□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
RNU6-131P-201
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BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
SNORA75.4-201
ENST00000391278
119 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MIR876-201
ENST00000401147
81 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
MTCO2P30-201
ENST00000503662
364 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
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Q16143
MIR4639-201
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BASIC
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□□□□□ -2.52
SNCB
Q16143
AC004223.4-201
ENST00000612426
332 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
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