Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNCBQ16143 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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