Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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NEDD8Q15843 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
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NEDD8Q15843 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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NEDD8Q15843 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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