Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHHQ15465 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHHQ15465 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHHQ15465 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHHQ15465 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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