Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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