Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NECTIN1Q15223 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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