Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
EEA1Q15075 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
EEA1Q15075 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms