Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB3GAP1Q15042 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms