Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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