Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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