Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CKAP5Q14008 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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CKAP5Q14008 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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CKAP5Q14008 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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CKAP5Q14008 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CKAP5Q14008 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CKAP5Q14008 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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