Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms