Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTCH1Q13635 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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