| PIN1 | Q13526 | RNU6-1007P-201 | ENST00000516586 | 107 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR4724-201 | ENST00000579485 | 89 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR5002-201 | ENST00000584713 | 97 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC087685.1-201 | ENST00000587507 | 141 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC006006.1-201 | ENST00000603082 | 144 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC027279.3-201 | ENST00000625055 | 122 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | KLRA1P-203 | ENST00000535939 | 2353 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | NEDD1-204 | ENST00000457368 | 3162 nt | TSL 2 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1084P-201 | ENST00000362498 | 107 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD33-201 | ENST00000362761 | 85 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR522-201 | ENST00000385071 | 87 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | NDUFB4P4-201 | ENST00000404822 | 243 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC023449.1-201 | ENST00000454464 | 154 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD2.1-201 | ENST00000458762 | 69 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC016885.2-201 | ENST00000522598 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC015688.6-201 | ENST00000577737 | 104 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.802-201 | ENST00000614892 | 130 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | FAS-AS1.2-201 | ENST00000620386 | 170 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC008163.1-205 | ENST00000413944 | 4649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNA5SP289-201 | ENST00000362332 | 137 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1209P-201 | ENST00000363655 | 107 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.277-201 | ENST00000364754 | 102 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | snoU2-30.1-201 | ENST00000365012 | 70 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR634-201 | ENST00000385208 | 97 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR802-201 | ENST00000390235 | 94 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR891A-201 | ENST00000401237 | 79 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | HMGN2P38-201 | ENST00000423806 | 265 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | HMGN2P32-201 | ENST00000444648 | 269 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SUMO2P16-201 | ENST00000519475 | 264 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RPL23AP91-201 | ENST00000569211 | 455 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR4778-201 | ENST00000577635 | 80 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | FANCD2-213 | ENST00000625535 | 117 nt | TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | WWP1P1-201 | ENST00000466609 | 2769 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | CCPG1-203 | ENST00000442196 | 3453 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | USP53-202 | ENST00000450251 | 6072 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIRLET7C-201 | ENST00000362160 | 84 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD27-201 | ENST00000363981 | 72 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.796-201 | ENST00000364268 | 102 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.799-201 | ENST00000364992 | 102 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-969P-201 | ENST00000383900 | 105 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA8.3-201 | ENST00000384679 | 139 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR526A2-201 | ENST00000390198 | 65 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | LINC02534-201 | ENST00000446525 | 283 nt | TSL 3 BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNA5SP200-201 | ENST00000516360 | 103 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR4422-201 | ENST00000581938 | 83 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | ASPM-202 | ENST00000367408 | 3747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | LRRCC1-202 | ENST00000414626 | 4493 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | TBL1XR1-208 | ENST00000430069 | 7948 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL136360.1-201 | ENST00000503377 | 1900 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | PTPRQ-209 | ENST00000616559 | 8165 nt | TSL 5 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-199P-201 | ENST00000362954 | 107 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-833P-201 | ENST00000363486 | 107 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.242-201 | ENST00000364473 | 110 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-338P-201 | ENST00000383888 | 105 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.401-201 | ENST00000383965 | 117 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.477-201 | ENST00000384352 | 108 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA48.3-201 | ENST00000391081 | 134 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU2-40P-201 | ENST00000410833 | 196 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.618-201 | ENST00000410949 | 107 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL136320.1-201 | ENST00000417273 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | PIGPP3-201 | ENST00000425307 | 415 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC090255.1-201 | ENST00000495779 | 349 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC017015.2-201 | ENST00000497946 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC079140.2-201 | ENST00000506193 | 142 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC025887.1-201 | ENST00000578349 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR5688-201 | ENST00000580619 | 83 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| PIN1 | Q13526 | SEMG2-201 | ENST00000372769 | 2051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.111-201 | ENST00000363248 | 100 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNA5SP37-201 | ENST00000365420 | 130 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1065P-201 | ENST00000384513 | 106 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | KRTAP19-11P-201 | ENST00000439851 | 104 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC114811.1-201 | ENST00000507207 | 168 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR4282-201 | ENST00000583613 | 67 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | KNL1-204 | ENST00000527044 | 5404 nt | TSL 5 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.20-201 | ENST00000362479 | 113 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.122-201 | ENST00000363331 | 96 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD14E-201 | ENST00000364009 | 85 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNA5SP160-201 | ENST00000364866 | 120 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.307-201 | ENST00000365022 | 117 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU4-52P-201 | ENST00000384209 | 138 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RN7SKP51-201 | ENST00000410781 | 304 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL021397.1-201 | ENST00000451806 | 248 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-717P-201 | ENST00000459076 | 104 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.638-201 | ENST00000459374 | 113 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC079804.2-201 | ENST00000490376 | 200 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1023P-201 | ENST00000516137 | 106 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD45.4-201 | ENST00000516629 | 73 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1116P-201 | ENST00000517269 | 99 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR3937-201 | ENST00000580135 | 106 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC091965.1-202 | ENST00000607662 | 397 nt | TSL 3 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL442067.1-201 | ENST00000613261 | 223 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | SCARNA15.3-201 | ENST00000626315 | 122 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | SCARNA4.1-201 | ENST00000628597 | 123 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR302D-201 | ENST00000362275 | 68 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA20.1-201 | ENST00000364790 | 130 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |