Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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TUBB3Q13509 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUBB3Q13509 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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