Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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