Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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