Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CBX3Q13185 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CBX3Q13185 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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