Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ACACAQ13085 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.2 ms