Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MRPL28Q13084 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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