Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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