Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
STRN3Q13033 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
STRN3Q13033 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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