Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NPRL3Q12980 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NPRL3Q12980 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPRL3Q12980 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPRL3Q12980 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPRL3Q12980 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPRL3Q12980 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPRL3Q12980 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPRL3Q12980 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPRL3Q12980 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms