Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TFCP2Q12800 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TFCP2Q12800 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TFCP2Q12800 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 625.9 ms