Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LAMTOR4Q0VGL1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LAMTOR4Q0VGL1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.8 ms