Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms