Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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