Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTENP60484 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTENP60484 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTENP60484 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTENP60484 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTENP60484 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTENP60484 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTENP60484 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTENP60484 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTENP60484 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTENP60484 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTENP60484 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTENP60484 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms