Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERFP50548 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERFP50548 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERFP50548 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ERFP50548 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ERFP50548 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ERFP50548 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ERFP50548 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERFP50548 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ERFP50548 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ERFP50548 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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