Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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CASQ1P31415 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CASQ1P31415 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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