Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRBP23467 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
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